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Ce patrimoine naturel est étroitement lié aux enjeux économiques du territoire, en particulier au tourisme (balnéaire, thermal, naturaliste…), à la viticulture, à la conchyliculture ou à la pêche.
Ainsi, Thau agglo s’est engagée dans un processus de développement durable de son territoire riche en espaces naturels.
Les nombreux inventaires des Zones d’Intérêt Ecologiste Faunistique et Floristique (ZNIEFF) de type I et II, des zones humides, des Zones Importantes pour la Conservation des Oiseaux (ZICO), des sites classés ont permis de souligner l’intérêt écologique remarquable des espaces naturels et de mettre en évidence l’existence de grands ensembles naturels, riches et peu modifiés.